GameGuard gây ra nhiều phiền phức với các ứng dụng khác. Rất nhiều lỗi đã và đang được sửa.[1]

Rất nhiều tin tặc đang cố gắng vô hiệu GameGuard theo các cách mới khác. Ví dụ, đã có người nói rằng GameGuard vẫn có thể bị phá hoại bằng cách chỉnh sửa tệp của trò chơi, hoặc sử dụng các phiên bản chỉnh sửa của Cheat Engine cùng với một mớ các trình giả lập máy chủ. nProtect GameGuard thường xuyên tự cập nhật để bảo vệ trước các nguy cơ mới nhất. Mặc dù được quảng cáo là có hiệu quả, tin tặc có thể phá hoại hoặc qua mặt GameGuard nhanh hơn nó đang cập nhật, cho nên hệ thống kết xuất thực sự vô ích. Đặc biệt các trang có cài các chương trình 'bot' làm loạn trò chơi để kiếm tiền và các vật phẩm hiếm, sau đó bán ra bằng tiền thật. Các trang web và 'bots' vẫn còn đang chạy, để qua mặt GameGuard, chỉ một giờ sau khi cập nhật phiên bản mới nhất.

Ở Lineage II, Cabal Online và Ragnarok Online GameGuard thường bị qua mặt sau vài giờ được cập nhật. Trò 9Dragons là một ví dụ điển hình - cho dù GameGuard cập nhật tới tấp, các game thủ Việt Nam tiếp tục hack dẫn đến nhà cung cấp chặn tất cả các địa chỉ IP xuất phát từ Việt Nam.

Ở một số trò như MapleStory, trò chơi tự kiểm định hash của GameGuard đang dùng và sẽ thoát nếu không trùng với hash có trên máy chủ.[cần dẫn nguồn] Đây là thước đo bảo mật cho nProtect GameGuard để đảm bảo rằng GameGuard chưa bị hack và nProtect GameGuard nên cập nhật lên phiên bản mới nhất.

GameGuard còn có thể bị chặn với các phần mềm gói tin, như PacketHack của Nga được thiết kế để chặn gói và hack ở cấp độ net-driver.

Một số máy chạy Windows XP gặp vấn đề với GameGuard vì sử dụng chung "Mã sản phẩm Windows" cài đặt ở hai máy tính trên cùng một bộ định tuyến.

GameGuard hiện tại không tương thích với Windows 7 Build 7000 - nó ngừng chạy với lỗi "Error Initializing (0)", cho nên các trò chơi sử dụng GameGuard đương nhiên là không tương thích với Windows 7[2].

Vì phương thức làm việc của GameGuard là sục sạo vào các DLL thiết yếu, nên không thể chạy các trò chơi được bảo vệ bởi GameGuard bằng các trình giả lập Windows API, như Wine hoặc Cedega ở các hệ Unix. Vấn đề chốt yếu ở đây là GameGuard cố gắng vượt tường rào an toàn của hệ điều hành để:

• Ẩn tiến trình trò chơi.
• Theo dõi toàn bộ dãy bộ nhớ.
• Tắt các ứng dụng chỉ định không thông qua người dùng.
• Chặn các hàm gọi đến DirectX và Windows API.